Pemodelan Berbasis Jaringan untuk Pengklasifikasian Kanker Payudara Berdasarkan Data Molekuler

Mushthofa, Chamdan L Abdulbaaqiy, Sony Hartono Wijaya, Muhammad Asyhar Agmalaro, Lailan Sahrina Hasibuan

Abstrak

Kanker merupakan penyakit yang ditandai dengan pertumbuhan sel yang tidak terkendali. Salah satu ciri dari adanya sel yang tumbuh tidak terkendali adalah adanya estrogen-reseptor-positif (ER+). Sekitar 67% hasil tes kanker payudara memiliki ER+. Profil kanker payudara dibagi menjadi 4 sub-tipe yaitu: Luminal A, Luminal B, basal-like, dan HER-2 enriched. Masing-masing kategori memiliki pengaruh yang berbeda terhadap kemoterapi adjuvant. Pada penelitian ini, digunakan pendekatan berbasis jaringan (network) untuk melakukan pemilihan fitur/biomarker molekuler yang berpotensi untuk membantu pemodelan dan klasifikasi sub-tipe kanker payudara. Fitur molekuler yang digunakan yaitu Copy Number Alteration (CNA) dan ekspresi gen. Hasil pemilihan fitur tersebut dibandingkan dengan akurasi berbasis fitur PAM50 dari studi literatur. Dari hasil penelitian didapatkan bahwa fitur dari metode seleksi berbasis jaringan ini mampu menghasilkan performa yang sebanding dengan fitur PAM50 dan dapat menjadi alternatif untuk melakukan klasifikasi jenis kanker payudara.

Penulis

Mushthofa
mush@apps.ipb.ac.id (Kontak utama)
Chamdan L Abdulbaaqiy
Sony Hartono Wijaya
Muhammad Asyhar Agmalaro
Lailan Sahrina Hasibuan
Mushthofa, AbdulbaaqiyC. L., WijayaS. H., AgmalaroM. A., & HasibuanL. S. (2022). Pemodelan Berbasis Jaringan untuk Pengklasifikasian Kanker Payudara Berdasarkan Data Molekuler. Jurnal Ilmu Komputer Dan Agri-Informatika, 9(1), 101-113. https://doi.org/10.29244/jika.9.1.101-113

Rincian Artikel

Perbandingan Model AlexNet dan ResNet dalam Klasifikasi Citra Bunga Memanfaatkan Transfer Learning

Bana Falakhi, Elmira Faustina Achmal, Muhammad Rizaldi, Renata Rizki Rafi' Athallah, Novanto...
Abstract View : 264
Unduh :416

Deteksi Spam pada Twitter Menggunakan Algoritme Naïve Bayes

Andita Wahyuningtyas, Imas Sukaesih Sitanggang, Husnul Khotimah
Abstract View : 681
Unduh :929

Klasifikasi Metagenom dengan Metode Naïve Bayes Classifier

Dian Kartika Utami, Wisnu Ananta Kusuma, Agus Buono
Abstract View : 1852
Unduh :1114